江苏省农产品质量检验测试南通中心是我省一家区域性的农产品质检机构。2001年初由南通市人民政府投资筹建，2001年月日江苏省农林厅发文同意筹建江苏省农产品质量监督检验测试南通中心[苏农计2001年（103）号]，中心的性质为全额拨款的全民事业单位，具体业务接受上级业务主管部门江苏省农产品质量检验测试中心指导。

    2002年12月26日江苏省农产品质量检验测试南通中心正式揭牌，2003年中心通过省级计量认证，2003年8月28日中心通过江苏省农林厅区域中心的行业管理认证，2004年2月9日江苏省农产品质量检验测试南通中心被农业部农产品质量安全中心正式列为全国无公害农产品认证委托检验的定点检测机构。

    南通中心的建立完全依托南通市农产品检验测试中心，目前与南通市农产品检验测试中心一个机构两块牌子，合署办公，开展各项工作。